Գոյություն ունեն մի քանի տարբեր բծեր, որոնք կարող են օգտագործվել, որպեսզի պատկերացնեն եւ լուսանկարեն ԴՆԹ-ն, հետո նյութը բաժանված է գել էլեկտրոֆորեզից: Շատ ընտրությունների շարքում այս հինգ շտամները ամենատարածվածն են Ethidium bromide- ով, որն առավել լայնորեն օգտագործված է: Այս գործընթացի հետ աշխատելիս կարեւոր է ոչ միայն իմանալ շտամների միջեւ տարբերությունները, այլ նաեւ առողջական ռիսկերը:
01 Ethidium Bromide- ը
Ethidium bromide- ը, հավանաբար, ԴՆԹ-ն տեսնելու համար օգտագործվում է ամենատարածված ներկը: Այս ներկը կարող է օգտագործվել գել խառնուրդի մեջ, էլեկտրոֆորեզի բուֆերներում կամ գել այն գելուց հետո: Ներկանյութի մոլեկուլները հավատարիմ են ԴՆԹ ծերերին եւ ցերեկային լույսի տակ գտնվող ֆլուորեսին `ցույց տալով, թե որտեղ են խողովակները գել ներսում: Չնայած իր առավելությանը, ապա անկումը այն է, որ ethidium bromide- ը պոտենցիալ քաղցկեղ է, ուստի այն պետք է վարվի մեծ խնամքով: Այս գելի հետ աշխատելու պոտենցիալ առողջության ռիսկերի պատճառով հնարավոր է գտնել այլընտրանք: 02 SYBR Gold
SYBR ոսկու ներկը կարելի է օգտագործել երկակի կամ միակողմանի ԴՆԹ-ի բորբոքում կամ RNA- ի բորբոքում: SYBR Gold- ը ethidium bromide- ի առաջին տարբերակներից մեկն է, որը շուկայական հարված է հասցնում եւ այն համարվում է զգայուն, քան ethidium bromide- ը: Ներկանյութը 1000 անգամ ավելի մեծ UV ֆլուորեսցենտ է պարունակում, երբ այն կապված է նուկլեինաթթուների հետ: Այնուհետեւ թափանցում է հաստ եւ բարձր տոկոսը, agarose gels եւ կարող են օգտագործվել formaldehyde gels. Քանի որ անքակտելի մոլեկուլի ֆլուորեսցիան այնքան ցածր է, պաշարումը պարտադիր չէ: Լիցենզավորված սեփականատեր Մոլեկուլային պրոբլեմները նույնպես (SYBR Gold- ի գործարկումը սկսվելուց հետո) մշակել եւ վաճառել է SYBR Safe եւ SYBR Green- ը, որոնք անվտանգ են այլընտրանքային bromide- ի համար:
03 SYBR Կանաչ
The SYBR Green I եւ II stains (նորից, շուկա կողմից Molecular Probes) են օպտիմիզացված տարբեր նպատակներով: Քանի որ նրանք կապում են ԴՆԹ-ին, դրանք դեռեւս համարվում են պոտենցիալ mutagens եւ դրա պատճառով պետք է խնամքով վարվել: SYBR Green I- ն ավելի զգայուն է կրկնակի շերտավորված ԴՆԹ-ի օգտագործման համար, իսկ SYBR Green II, մյուս կողմից, լավագույնս օգտագործվում է միայնակ ծածկված ԴՆԹ-ով կամ ՌՆԹ-ով: Ինչպես հայտնի Ethidium Bromide բիծը, այդ բարձր զգայուն բծերը fluoresce տակ UV լույսի. 04 SYBR Անվտանգ
SYBR Safe- ը նախատեսված է ավելի անվտանգ այլընտրանք Ethidium Bromide- ի եւ այլ SYBR- ի լանջերի համար: Այն չի համարվում վտանգավոր թափոններ եւ կարող է ընդհանուր առմամբ տեղադրվել կանոնավոր կոյուղու համակարգերի միջոցով (այսինքն `քսում), քանի որ թունավորության փորձարկումը ցույց է տալիս, որ սուր թունավորություն չկա: Փորձարկումն էլ ցույց է տալիս, որ քիչ քանակությամբ կամ ոչ մի գենոտոքսիա չկա սիրիական Hamster Embryo (SHE) բջիջների, մարդու լիմֆոցիտների, մկնիկի լիմֆոմայի բջիջների եւ AMES թեստի վերաբերյալ: Բիծը կարող է օգտագործվել կապույտ-լույսով տրանսիլլինգատորով, որն առաջացնում է ԴՆԹ-ի ավելի քիչ վնաս, որն արտացոլվում է եւ ավելի արդյունավետ է դարձնում հետագա կլոնավորման համար: 05 Էվա Կանին
Eva Green- ը կանաչ լույսի ցերեկային ներկ է, որը հայտնաբերվել է PCR- ի արհեստական ներարկումն ավելի փոքր չափով, քան մյուս ներկերը: Սա շատ օգտակար է այնպիսի ծրագրերի համար, ինչպիսիք են քանակական իրական ժամանակի PCR- ը: Դա նաեւ լավ ընտրություն է, եթե դուք օգտագործում եք ցածր հալեցման կետի գլելներ, ԴՆԹ-ի վերականգնման համար: Այն շատ կայուն է բարձր ջերմաստիճաններում եւ ունի շատ ցածր ֆլուորեսցենտ ինքնին, բայց մեծ ցերեկային լույսի ժամանակ, երբ կապված է ԴՆԹ-ին: Եվա Գրինը նույնպես ցուցադրվել է շատ ցածր կամ ոչ ցիտոտոքսիկություն կամ mutagenicity: